Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | +31 | 23-255 | 233 | 256-259 | 1-1 | 2-22 | 1 | 3 | slipknot |
Chain Sequence |
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
+ 31 | 25-256 | 232 | 1-24, 257-259 | 24 | 3 | knot |
Fingerprint | Knot forming loop | Loop type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
|
K +31 | His3 ... His94 <-> Bridging ionZn262 <-> His96 ... Chain closureLys261 <-> His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... Cys206 <-> Bridging ionHg263 <-> Gln137 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His3 ... His96 <-> Bridging ionZn262 <-> His119 ... Chain closureLys261 <-> His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His3 ... His94 <-> Bridging ionZn262 <-> His119 ... Chain closureLys261 <-> His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... Glu205 <-> Bridging ionHg263 <-> Gln137 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... Cys206 <-> Bridging ionHg263 <-> Gln137 ... His96 <-> Bridging ionZn262 <-> His94 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... Cys206 <-> Bridging ionHg263 <-> Gln137 ... His119 <-> Bridging ionZn262 <-> His96 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... Cys206 <-> Bridging ionHg263 <-> Gln137 ... His119 <-> Bridging ionZn262 <-> His94 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... Glu205 <-> Bridging ionHg263 <-> Gln137 ... His96 <-> Bridging ionZn262 <-> His94 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... Glu205 <-> Bridging ionHg263 <-> Gln137 ... His119 <-> Bridging ionZn262 <-> His96 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... Glu205 <-> Bridging ionHg263 <-> Gln137 ... His119 <-> Bridging ionZn262 <-> His94 ... His3 |
probabilistic |
Chain Sequence |
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knotoid cutoff: 0.5
Knotoid matrix content: 1
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | 3.1 | 28-257 | 230 | 1-27, 258-258 | 27 | 1 | knot | |||||
view details | 2.1 | 25-252 | 228 | 1-24 | 258-258 | 253-257 | 24 | 1 | slipknot |
sequence length |
258
|
structure length |
258
|
publication title |
Combinatorial computational method gives new picomolar ligands for a known enzyme.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Lyase
|
molecule keywords |
CARBONIC ANHYDRASE II
|
source organism |
Homo sapiens
|
total genus |
Genus: 72
|
ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonate dehydratase. |
pdb deposition date | 2001-04-12 |
KnotProt deposition date | 2018-10-03 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00194 | Carb_anhydrase | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II | ||
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II |
#chains in the KnotProt database with same CATH superfamily 2NXS A; 1LG6 A; 3LXE A; 1CA2 A; 3DA2 A; 3IBN A; 1UGF A; 1FQM A; 3KOK A; 2WEH A; 9CA2 A; 3M67 A; 1IF4 A; 1TBT X; 1CNY A; 3DVB A; 3DBU A; 1KWQ A; 1BNM A; 1V9I C; 3HLJ A; 2ZNC A; 1KEQ A; 1FSQ A; 3BET A; 3D92 A; 2POU A; 2NXT A; 1FQL A; 2HNC A; 1G4O A; 1I91 A; 2CA2 A; 1BN3 A; 2WEG A; 1ZSA A; 2AX2 A; 1YO2 A; 1TG9 A; 1BNQ A; 1G46 A; 2IT4 A; 1YO0 A; 1ZNC A; 1KWR A; 1UGA A; 1I90 A; 3F7U A; 3M5E A; 1A42 A; 3DCC A; 3MDZ A; 3FW3 A; 2NWY A; 2Q1B A; 3MHI A; 1YDB A; 1HUH A; 1G48 A; 3HKN A; 2O4Z A; 1BN1 A; 3BL1 A; 1I9Q A; 1AM6 A; 1CAL A; 2NWO A; 3MNA A; 3IBU A; 1ZE8 A; 1I9O A; 1HEC A; 1OKN A; 3HFP A; 1G0E A; 1HEA A; 3DC9 A; 2NNO A; 3M2Z A; 5CAC A; 1HEB A; 1URT A; 1BNU A; 5CA2 A; 2FMG A; 1FQR A; 1TTM A; 1TG3 A; 2Q1Q A; 2X7S A; 3CZV A; 1XEG A; 3OIK A; 1G4J A; 3F4X A; 2CAB A; 2CBA A; 2EU3 A; 1CZM A; 2NNS A; 3NJ9 A; 3MNU A; 1UGE A; 2CBB A; 1HED A; 3B1B A; 3MYQ A; 2FOU A; 1CNW A; 1I8Z A; 1OQ5 A; 1CIL A; 1I9P A; 1CAM A; 2CBD A; 2CBC A; 1F2W A; 1I9L A; 3P4V A; 2NN7 A; 3K2F A; 1FLJ A; 1H4N A; 3OIL A; 2ABE A; 3MHC A; 1BCD A; 3DVC A; 1DCB A; 3PO6 A; 1CVC A; 1YO1 A; 1CVH A; 1CAN A; 1CAZ A; 2NXR A; 3B4F A; 3F8E A; 2X7T A; 1Y7W A; 1XEV A; 1TH9 A; 6CA2 A; 3MNI A; 3MNJ A; 2CBE A; 2HOC A; 3N2P A; 3D93 A; 2HKK A; 1FSR A; 2FNN A; 1CNH A; 1CNX A; 1TEU X; 3EFI A; 1BZM A; 3C7P A; 2GEH A; 1Z97 A; 3NI5 A; 1HCB A; 3JXF A; 1BN4 A; 2Q38 A; 1ZSB A; 2ILI A; 1YDA A; 1RZE A; 2HFX A; 1YDD A; 1FR7 A; 4CA2 A; 3N3J A; 3HKT A; 1XPZ A; 3EFT A; 2WEO A; 1CVE A; 3MNH A; 3BL0 A; 3M98 A; 1EOU A; 3CA2 A; 1BNW A; 1HVA A; 3DC3 A; 2OSM A; 2POW A; 1CCS A; 1IF5 A; 3CAJ A; 3DCW A; 1CCU A; 3OIM A; 1HCA A; 1YDC A; 4PYY A; 2W2J A; 1CRM A; 2F14 A; 1OKM A; 1TE3 X; 1G53 A; 3M1W A; 2WD3 A; 3GZ0 A; 3DD8 A; 1RZB A; 2HFW A; 2NMX A; 1CNI A; 1CAJ A; 2FW4 A; 3FE4 A; 3OKU A; 2NWZ A; 1CVA A; 3MHM A; 1CRA A; 1IF6 A; 3DVD A; 1UGD A; 1CAY A; 1CAI A; 3DV7 A; 3N0N A; 1CNG A; 4CAC A; 1CVD A; 3M3X A; 2H15 A; 3R16 A; 1CVB A; 1DCA A; 3KIG A; 3M1J A; 1LUG A; 2NN1 A; 1FSN A; 2FNK A; 3HKQ A; 3N4B A; 2NWP A; 3MHL A; 3ML2 A; 3M2N A; 1JD0 A; 3ZNC A; 1LGD A; 3DAZ A; 3D8W A; 1J9W A; 3HS4 A; 7CA2 A; 3MNK A; 1CIM A; 3K34 A; 3D0N A; 1IF7 A; 1V9E A; 3JXG A; 2POV A; 1CNJ A; 1H9N A; 2HL4 A; 1KOP A; 3IBI A; 1CNC A; 3IEO A; 3HKU A; 3IQK A; 1LG5 A; 1XQ0 A; 3DD0 A; 1CA3 A; 3OKV A; 3FFP X; 1RZA A; 1G52 A; 1I9N A; 3IBL A; 1RJ6 A; 1G3Z A; 1IF9 A; 1CAK A; 2AW1 A; 3M96 A; 3PYK A; 1BIC A; 3M5T A; 3DCS A; 3K7K A; 3ML5 A; 1JV0 A; 2FOQ A; 3MMF A; 3KS3 A; 1H9Q A; 1T9N A; 2FOS A; 2HFY A; 3KKX A; 1RZC A; 3MZC A; 1AVN A; 1CVF A; 1G6V A; 1RJ5 A; 12CA A; 1HUG A; 1MUA A; 3IGP A; 1Z93 A; 3M5S A; 3D9Z A; 3F7B A; 2NNV A; 3IAI A; 3L14 A; 1G0F A; 1I9M A; 1G45 A; 1BNV A; 1CAO A; 2OSF A; 2NNG A; 1AZM A; 1CAH A; 1BNN A; 2VVA X; 2HD6 A; 2FNM A; 1G1D A; 1CCT A; 1ZSC A; 2WD2 A; 2EU2 A; 3M2Y A; 8CA2 A; 1KOQ A; 3M40 A; 3JXH C; 1RAY A; 2GD8 A; 1FQN A; 3R17 B; 1BNT A; 1THK A; 2FMZ A; 1DMY A; 3MHO A; 2VVB X; 1RZD A; 1UGB A; 1IF8 A; 1BV3 A; 1CIN A; 3KON A; 3M1Q A; 2EZ7 A; 3MWO A; 1LZV A; 1FR4 A; 2WEJ A; 3KWA A; 1RAZ A; 2X7U A; #chains in the KnotProt database with same CATH topology 2NXS A; 1LG6 A; 3LXE A; 1CA2 A; 3DA2 A; 3IBN A; 1UGF A; 1FQM A; 3KOK A; 2WEH A; 9CA2 A; 3M67 A; 1IF4 A; 1TBT X; 1CNY A; 3DVB A; 3DBU A; 1KWQ A; 1BNM A; 1V9I C; 3HLJ A; 2ZNC A; 1KEQ A; 1FSQ A; 3BET A; 3D92 A; 2POU A; 2NXT A; 1FQL A; 2HNC A; 1G4O A; 1I91 A; 2CA2 A; 1BN3 A; 2WEG A; 1ZSA A; 2AX2 A; 1YO2 A; 1TG9 A; 1BNQ A; 1G46 A; 2IT4 A; 1YO0 A; 1ZNC A; 1KWR A; 1UGA A; 1I90 A; 3F7U A; 3M5E A; 1A42 A; 3DCC A; 3MDZ A; 3FW3 A; 2NWY A; 2Q1B A; 3MHI A; 1YDB A; 1HUH A; 1G48 A; 3HKN A; 2O4Z A; 1BN1 A; 3BL1 A; 1I9Q A; 1AM6 A; 1CAL A; 2NWO A; 3MNA A; 3IBU A; 1ZE8 A; 1I9O A; 1HEC A; 1OKN A; 3HFP A; 1G0E A; 1HEA A; 3DC9 A; 2NNO A; 3M2Z A; 5CAC A; 1HEB A; 1URT A; 1BNU A; 5CA2 A; 2FMG A; 1FQR A; 1TTM A; 1TG3 A; 2Q1Q A; 2X7S A; 3CZV A; 1XEG A; 3OIK A; 1G4J A; 3F4X A; 2CAB A; 2CBA A; 2EU3 A; 1CZM A; 2NNS A; 3NJ9 A; 3MNU A; 1UGE A; 2CBB A; 1HED A; 3B1B A; 3MYQ A; 2FOU A; 1CNW A; 1I8Z A; 1OQ5 A; 1CIL A; 1I9P A; 1CAM A; 2CBD A; 2CBC A; 1F2W A; 1I9L A; 3P4V A; 2NN7 A; 3K2F A; 1FLJ A; 1H4N A; 3OIL A; 2ABE A; 3MHC A; 1BCD A; 3DVC A; 1DCB A; 3PO6 A; 1CVC A; 1YO1 A; 1CVH A; 1CAN A; 1CAZ A; 2NXR A; 3B4F A; 3F8E A; 2X7T A; 1Y7W A; 1XEV A; 1TH9 A; 6CA2 A; 3MNI A; 3MNJ A; 2CBE A; 2HOC A; 3N2P A; 3D93 A; 2HKK A; 1FSR A; 2FNN A; 1CNH A; 1CNX A; 1TEU X; 3EFI A; 1BZM A; 3C7P A; 2GEH A; 1Z97 A; 3NI5 A; 1HCB A; 3JXF A; 1BN4 A; 2Q38 A; 1ZSB A; 2ILI A; 1YDA A; 1RZE A; 2HFX A; 1YDD A; 1FR7 A; 4CA2 A; 3N3J A; 3HKT A; 1XPZ A; 3EFT A; 2WEO A; 1CVE A; 3MNH A; 3BL0 A; 3M98 A; 1EOU A; 3CA2 A; 1BNW A; 1HVA A; 3DC3 A; 2OSM A; 2POW A; 1CCS A; 1IF5 A; 3CAJ A; 3DCW A; 1CCU A; 3OIM A; 1HCA A; 1YDC A; 4PYY A; 2W2J A; 1CRM A; 2F14 A; 1OKM A; 1TE3 X; 1G53 A; 3M1W A; 2WD3 A; 3GZ0 A; 3DD8 A; 1RZB A; 2HFW A; 2NMX A; 1CNI A; 1CAJ A; 2FW4 A; 3FE4 A; 3OKU A; 2NWZ A; 1CVA A; 3MHM A; 1CRA A; 1IF6 A; 3DVD A; 1UGD A; 1CAY A; 1CAI A; 3DV7 A; 3N0N A; 1CNG A; 4CAC A; 1CVD A; 3M3X A; 2H15 A; 3R16 A; 1CVB A; 1DCA A; 3KIG A; 3M1J A; 1LUG A; 2NN1 A; 1FSN A; 2FNK A; 3HKQ A; 3N4B A; 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#chains in the KnotProt database with same CATH homology 2NXS A; 1LG6 A; 3LXE A; 1CA2 A; 3DA2 A; 3IBN A; 1UGF A; 1FQM A; 3KOK A; 2WEH A; 9CA2 A; 3M67 A; 1IF4 A; 1TBT X; 1CNY A; 3DVB A; 3DBU A; 1KWQ A; 1BNM A; 1V9I C; 3HLJ A; 2ZNC A; 1KEQ A; 1FSQ A; 3BET A; 3D92 A; 2POU A; 2NXT A; 1FQL A; 2HNC A; 1G4O A; 1I91 A; 2CA2 A; 1BN3 A; 2WEG A; 1ZSA A; 2AX2 A; 1YO2 A; 1TG9 A; 1BNQ A; 1G46 A; 2IT4 A; 1YO0 A; 1ZNC A; 1KWR A; 1UGA A; 1I90 A; 3F7U A; 3M5E A; 1A42 A; 3DCC A; 3MDZ A; 3FW3 A; 2NWY A; 2Q1B A; 3MHI A; 1YDB A; 1HUH A; 1G48 A; 3HKN A; 2O4Z A; 1BN1 A; 3BL1 A; 1I9Q A; 1AM6 A; 1CAL A; 2NWO A; 3MNA A; 3IBU A; 1ZE8 A; 1I9O A; 1HEC A; 1OKN A; 3HFP A; 1G0E A; 1HEA A; 3DC9 A; 2NNO A; 3M2Z A; 5CAC A; 1HEB A; 1URT A; 1BNU A; 5CA2 A; 2FMG A; 1FQR A; 1TTM A; 1TG3 A; 2Q1Q A; 2X7S A; 3CZV A; 1XEG A; 3OIK A; 1G4J A; 3F4X A; 2CAB A; 2CBA A; 2EU3 A; 1CZM A; 2NNS A; 3NJ9 A; 3MNU A; 1UGE A; 2CBB A; 1HED A; 3B1B A; 3MYQ A; 2FOU A; 1CNW A; 1I8Z A; 1OQ5 A; 1CIL A; 1I9P A; 1CAM A; 2CBD A; 2CBC A; 1F2W A; 1I9L A; 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3MHL A; 3ML2 A; 3M2N A; 1JD0 A; 3ZNC A; 1LGD A; 3DAZ A; 3D8W A; 1J9W A; 3HS4 A; 7CA2 A; 3MNK A; 1CIM A; 3K34 A; 3D0N A; 1IF7 A; 1V9E A; 3JXG A; 2POV A; 1CNJ A; 1H9N A; 2HL4 A; 1KOP A; 3IBI A; 1CNC A; 3IEO A; 3HKU A; 3IQK A; 1LG5 A; 1XQ0 A; 3DD0 A; 1CA3 A; 3OKV A; 3FFP X; 1RZA A; 1G52 A; 1I9N A; 3IBL A; 1RJ6 A; 1G3Z A; 1IF9 A; 1CAK A; 2AW1 A; 3M96 A; 3PYK A; 1BIC A; 3M5T A; 3DCS A; 3K7K A; 3ML5 A; 1JV0 A; 2FOQ A; 3MMF A; 3KS3 A; 1H9Q A; 1T9N A; 2FOS A; 2HFY A; 3KKX A; 1RZC A; 3MZC A; 1AVN A; 1CVF A; 1G6V A; 1RJ5 A; 12CA A; 1HUG A; 1MUA A; 3IGP A; 1Z93 A; 3M5S A; 3D9Z A; 3F7B A; 2NNV A; 3IAI A; 3L14 A; 1G0F A; 1I9M A; 1G45 A; 1BNV A; 1CAO A; 2OSF A; 2NNG A; 1AZM A; 1CAH A; 1BNN A; 2VVA X; 2HD6 A; 2FNM A; 1G1D A; 1CCT A; 1ZSC A; 2WD2 A; 2EU2 A; 3M2Y A; 8CA2 A; 1KOQ A; 3M40 A; 3JXH C; 1RAY A; 2GD8 A; 1FQN A; 3R17 B; 1BNT A; 1THK A; 2FMZ A; 1DMY A; 3MHO A; 2VVB X; 1RZD A; 1UGB A; 1IF8 A; 1BV3 A; 1CIN A; 3KON A; 3M1Q A; 2EZ7 A; 3MWO A; 1LZV A; 1FR4 A; 2WEJ A; 3KWA A; 1RAZ A; 2X7U A;
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