Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | +31 | 20-255 | 236 | 256-259 | 1-1 | 2-19 | 1 | 3 | slipknot |
Chain Sequence |
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
+ 31 | 27-255 | 229 | 1-26, 256-259 | 26 | 4 | knot |
Fingerprint | Knot forming loop | Loop type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... His96 <-> Bridging ionZn262 <-> His94 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His3 ... His96 <-> Bridging ionZn262 <-> His119 ... Chain closureLys261 <-> His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His3 ... His94 <-> Bridging ionZn262 <-> His119 ... Chain closureLys261 <-> His3 |
probabilistic |
Chain Sequence |
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knotoid cutoff: 0.5
Knotoid matrix content: 1
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | 3.1 | 25-257 | 233 | 1-24, 258-258 | 24 | 1 | knot | |||||
view details | 2.1 | 25-252 | 228 | 1-24 | 258-258 | 253-257 | 24 | 1 | slipknot |
sequence length |
258
|
structure length |
258
|
publication title |
First Crystal Structures of Human Carbonic Anhydrase II in Complex with Dual Aromatase-Steroid Sulfatase Inhibitors(,)
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Lyase
|
molecule keywords |
Carbonic anhydrase II
|
source organism |
Homo sapiens
|
total genus |
Genus: 76
|
ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonate dehydratase. |
pdb deposition date | 2004-10-11 |
KnotProt deposition date | 2018-10-18 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00194 | Carb_anhydrase | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II | ||
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II |
#chains in the KnotProt database with same CATH superfamily 2NXS A; 1LG6 A; 3LXE A; 1CA2 A; 3DA2 A; 3IBN A; 1UGF A; 1FQM A; 3KOK A; 2WEH A; 9CA2 A; 3M67 A; 1IF4 A; 1TBT X; 1CNY A; 3DVB A; 3DBU A; 1KWQ A; 1BNM A; 1V9I C; 3HLJ A; 2ZNC A; 1KEQ A; 1FSQ A; 3BET A; 3D92 A; 2POU A; 2NXT A; 1FQL A; 2HNC A; 1G4O A; 1I91 A; 2CA2 A; 1BN3 A; 2WEG A; 1ZSA A; 2AX2 A; 1YO2 A; 1TG9 A; 1BNQ A; 1G46 A; 2IT4 A; 1YO0 A; 1ZNC A; 1KWR A; 1UGA A; 1I90 A; 3F7U A; 3M5E A; 1A42 A; 3DCC A; 3MDZ A; 3FW3 A; 2NWY A; 2Q1B A; 3MHI A; 1YDB A; 1HUH A; 1G48 A; 3HKN A; 2O4Z A; 1BN1 A; 3BL1 A; 1I9Q A; 1AM6 A; 1CAL A; 2NWO A; 3MNA A; 3IBU A; 1ZE8 A; 1I9O A; 1HEC A; 1OKN A; 3HFP A; 1G0E A; 1HEA A; 3DC9 A; 2NNO A; 3M2Z A; 5CAC A; 1HEB A; 1URT A; 1BNU A; 5CA2 A; 2FMG A; 1FQR A; 1TTM A; 1TG3 A; 2Q1Q A; 2X7S A; 3CZV A; 1XEG A; 3OIK A; 1G4J A; 3F4X A; 2CAB A; 2CBA A; 2EU3 A; 1CZM A; 2NNS A; 3NJ9 A; 3MNU A; 1UGE A; 2CBB A; 1HED A; 3B1B A; 3MYQ A; 2FOU A; 1CNW A; 1I8Z A; 1OQ5 A; 1CIL A; 1I9P A; 1CAM A; 2CBD A; 2CBC A; 1F2W A; 1I9L A; 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