Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details |
![]() |
+31 | 21-256 | 236 | 257-259 | 1-1 | 2-20 | 1 | 2 | slipknot |
Chain Sequence |
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTHGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() |
+ 31 | 25-256 | 232 | 257-259 | 1-1 | 2-24 | 1 | 2 | slipknot |
Fingerprint | Knot forming loop | Loop type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
|
K +31 | Chain closureHis3 <-> Lys261 ... His96 <-> Bridging ionZn262 <-> His94 ... His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His3 ... His96 <-> Bridging ionZn262 <-> His119 ... Chain closureLys261 <-> His3 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His3 ... His94 <-> Bridging ionZn262 <-> His119 ... Chain closureLys261 <-> His3 |
probabilistic |
Chain Sequence |
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTHGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knotoid cutoff: 0.5
Knotoid matrix content: 1
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details |
![]() |
3.1 | 27-257 | 231 | 1-26, 258-258 | 26 | 1 | knot | ||||
view details |
![]() |
2.1 | 25-252 | 228 | 1-24 | 258-258 | 253-257 | 24 | 1 | slipknot |
sequence length |
258
|
structure length |
258
|
publication title |
Structural and kinetic study of the extended active site for proton transfer in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Proton transport
|
molecule keywords |
Carbonic anhydrase 2
|
source organism |
Homo sapiens
|
total genus |
![]() |
ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonate dehydratase. |
pdb deposition date | 2010-04-21 |
KnotProt deposition date | 2018-10-20 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00194 | Carb_anhydrase | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II | ||
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II |
#chains in the KnotProt database with same CATH superfamily 2VVA X; 1H9Q A; 1CNI A; 3KOK A; 1XPZ A; 1FQR A; 1AZM A; 3D9Z A; 2FOU A; 3DC9 A; 2X7S A; 6CA2 A; 1CVC A; 3DV7 A; 1BNW A; 1URT A; 2WEO A; 2CBA A; 1BZM A; 1Z93 A; 1HEA A; 3K2F A; 2NWZ A; 3KS3 A; 2FNM A; 1HCB A; 1BN1 A; 1MUA A; 1HED A; 3N4B A; 3IEO A; 3OKU A; 1G48 A; 1TEU X; 3KWA A; 3IBU A; 1CAZ A; 1FSQ A; 1CNJ A; 8CA2 A; 1EOU A; 1I9L A; 4CAC A; 3M1W A; 3IAI A; 3DCS A; 1G0E A; 1A42 A; 1FQN A; 3CA2 A; 3N2P A; 1I91 A; 2NN1 A; 1CZM A; 2NN7 A; 1YDC A; 1RJ6 A; 3DC3 A; 2IT4 A; 2NNG A; 1RZD A; 1CVB A; 3DVB A; 1I9P A; 1CNG A; 2NXR A; 1G6V A; 2HFY A; 1G0F A; 3MHO A; 3KON A; 1CIL A; 3MNA A; 2NNS A; 1ZE8 A; 3P4V A; 3DVC A; 1CCS A; 1CAN A; 1CVE A; 3MNJ A; 3ML5 A; 1TH9 A; 3IBI A; 3LXE A; 2HOC A; 2X7U A; 3F8E A; 3FW3 A; 1DMY A; 3JXF A; 1TG3 A; 1TE3 X; 1CAY A; 4CA2 A; 1YDA A; 1CRM A; 2Q38 A; 3IBN A; 2EU2 A; 1G46 A; 3OKV A; 1J9W A; 1BIC A; 5CAC A; 4PYY A; 1IF5 A; 2CBE A; 3M2N A; 1OKM A; 3MZC A; 2CAB A; 3DBU A; 1CAJ A; 1CNY A; 1TG9 A; 3EFI A; 3PYK A; 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#chains in the KnotProt database with same CATH topology 2VVA X; 1H9Q A; 1CNI A; 3KOK A; 1XPZ A; 1FQR A; 1AZM A; 3D9Z A; 2FOU A; 3DC9 A; 2X7S A; 6CA2 A; 1CVC A; 3DV7 A; 1BNW A; 1URT A; 2WEO A; 2CBA A; 1BZM A; 1Z93 A; 1HEA A; 3K2F A; 2NWZ A; 3KS3 A; 2FNM A; 1HCB A; 1BN1 A; 1MUA A; 1HED A; 3N4B A; 3IEO A; 3OKU A; 1G48 A; 1TEU X; 3KWA A; 3IBU A; 1CAZ A; 1FSQ A; 1CNJ A; 8CA2 A; 1EOU A; 1I9L A; 4CAC A; 3M1W A; 3IAI A; 3DCS A; 1G0E A; 1A42 A; 1FQN A; 3CA2 A; 3N2P A; 1I91 A; 2NN1 A; 1CZM A; 2NN7 A; 1YDC A; 1RJ6 A; 3DC3 A; 2IT4 A; 2NNG A; 1RZD A; 1CVB A; 3DVB A; 1I9P A; 1CNG A; 2NXR A; 1G6V A; 2HFY A; 1G0F A; 3MHO A; 3KON A; 1CIL A; 3MNA A; 2NNS A; 1ZE8 A; 3P4V A; 3DVC A; 1CCS A; 1CAN A; 1CVE A; 3MNJ A; 3ML5 A; 1TH9 A; 3IBI A; 3LXE A; 2HOC A; 2X7U A; 3F8E A; 3FW3 A; 1DMY A; 3JXF A; 1TG3 A; 1TE3 X; 1CAY A; 4CA2 A; 1YDA A; 1CRM A; 2Q38 A; 3IBN A; 2EU2 A; 1G46 A; 3OKV A; 1J9W A; 1BIC A; 5CAC A; 4PYY A; 1IF5 A; 2CBE A; 3M2N A; 1OKM A; 3MZC A; 2CAB A; 3DBU A; 1CAJ A; 1CNY A; 1TG9 A; 3EFI A; 3PYK A; 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