| Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| view details |
 |
+31 | 24-264 | 241 | 1-23, 265-268 | 23 | 4 | knot |
Chain Sequence |
EEEGVEWGYEEGVEWGLVFPDANGEYQSPINLNSREARYDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILKSKSVLSGGPLPQGHEFELYEVRFHWGRENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGKEHVGLKAVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWILFRYPLTISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ
|
Knotoid cutoff: 0.5
Knotoid matrix content: 1
| Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| view details |
 |
2.1 | 25-263 | 239 | 1-24, 264-268 | 24 | 5 | knot | ||||
| view details |
 |
3.1 | 26-265 | 240 | 266-268 | 1-24 | 25-25 | 24 | 2 | slipknot |
| sequence length |
268
|
| structure length |
268
|
| publication title |
Crystal Structure of Human Carbonic Anhydrase-Related Protein Viii Reveals the Basis for Catalytic Silencing.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Lyase
|
| molecule keywords |
CARBONIC ANHYDRASE-RELATED PROTEIN
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
 Genus: 78
|
| ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonate dehydratase. ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase. ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase. |
| pdb deposition date | 2008-10-31 |
| KnotProt deposition date | 2018-09-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00194 | Carb_anhydrase | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II |
#chains in the KnotProt database with same CATH superfamily 2WEJ A; 3PYK A; 1CAH A; 3BET A; 1DMY A; 1XEG A; 1IF9 A; 2WEO A; 3BL1 A; 1UGD A; 2NMX A; 1THK A; 3JXG A; 1FSR A; 3F7U A; 2VVA X; 2FMZ A; 4CAC A; 1CAN A; 1JV0 A; 2IT4 A; 3MZC A; 3ZNC A; 1G48 A; 3OIM A; 3DCW A; 3DCS A; 3FW3 A; 2OSF A; 3DD0 A; 1CA3 A; 2GD8 A; 1HEC A; 1H9Q A; 1AVN A; 3IEO A; 1FR4 A; 3F4X A; 1CNX A; 1CVA A; 3OIL A; 2HFW A; 3MNI A; 2OSM A; 1KOP A; 1RAY A; 3K7K A; 5CAC A; 1XEV A; 2FOS A; 1V9I C; 3ML5 A; 1TBT X; 3BL0 A; 1F2W A; 3KON A; 1IF5 A; 8CA2 A; 2NXR A; 3M40 A; 3MNK A; 2ILI A; 1BV3 A; 1UGF A; 3N3J A; 2NNS A; 1T9N A; 1I9N A; 3HLJ A; 1IF4 A; 1AM6 A; 3HS4 A; 3ML2 A; 1G46 A; 2EU2 A; 1G1D A; 2EZ7 A; 2HFX A; 2CAB A; 2EU3 A; 3IQK A; 2HL4 A; 2WD3 A; 3EFT A; 1ZSC A; 3M2Z A; 3IAI A; 1G4J A; 1CNC A; 1YDC A; 3FFP X; 3M1Q A; 2FOU A; 1I9L A; 3HFP A; 1JD0 A; 2WEG A; 1CAY A; 1CAO A; 1CVF A; 3MWO A; 1HCA A; 1RZC A; 1OKN A; 2HFY A; 3F7B A; 3KKX A; 2NWY A; 3OKV A; 1CVE A; 3DVB A; 1HUH A; 1FQL A; 2NN1 A; 3M1W A; 2AW1 A; 3M3X A; 3D93 A; 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