Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | +31 | 23-254 | 232 | 1-22, 255-258 | 22 | 4 | knot |
Chain Sequence |
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
+ 31 | 21-255 | 235 | 256-258 | 1-1 | 2-20 | 1 | 2 | slipknot |
Fingerprint | Knot forming loop | Loop type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
|
K +31 | His4 ... His94 <-> Bridging ionZn262 <-> His96 ... Chain closureLys261 <-> His4 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His4 ... His96 <-> Bridging ionZn262 <-> His119 ... Chain closureLys261 <-> His4 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His4 ... His94 <-> Bridging ionZn262 <-> His119 ... Chain closureLys261 <-> His4 |
probabilistic |
Chain Sequence |
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knotoid cutoff: 0.5
Knotoid matrix content: 1
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | 3.1 | 23-256 | 234 | 1-22, 257-257 | 22 | 1 | knot | |||||
view details | 2.1 | 24-251 | 228 | 1-23 | 257-257 | 252-256 | 23 | 1 | slipknot |
sequence length |
257
|
structure length |
257
|
publication title |
Design of a carbonic anhydrase IX active-site mimic to screen inhibitors for possible anticancer properties
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Lyase
|
molecule keywords |
Carbonic anhydrase 2
|
source organism |
Homo sapiens
|
total genus |
Genus: 77
|
ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonate dehydratase. |
pdb deposition date | 2008-06-03 |
KnotProt deposition date | 2018-10-18 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00194 | Carb_anhydrase | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II | ||
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II |
#chains in the KnotProt database with same CATH superfamily 1FSQ A; 1I9L A; 1BNV A; 1CRA A; 2Q1Q A; 2OSF A; 3ML2 A; 1I9M A; 3K34 A; 1EOU A; 3FE4 A; 2NWP A; 3OIL A; 1YDC A; 3HLJ A; 2WEO A; 1BN4 A; 3MMF A; 1G45 A; 3D0N A; 7CA2 A; 3MHC A; 1HUG A; 1CAO A; 3B4F A; 1HCB A; 1IF4 A; 1MUA A; 3D9Z A; 1G53 A; 2WD3 A; 4PYY A; 2HKK A; 3HKT A; 3D92 A; 3N4B A; 1RAZ A; 3BET A; 3EFT A; 2X7U A; 3KWA A; 1TTM A; 1BNT A; 1HVA A; 1CA2 A; 3IBI A; 1F2W A; 3F7U A; 2FNN A; 1FQN A; 1G0F A; 3ML5 A; 1CRM A; 1OKN A; 3IGP A; 1G1D A; 1CAJ A; 2HFX A; 1ZE8 A; 3JXH C; 1CZM A; 1I9O A; 1CAM A; 1HEB A; 2IT4 A; 2WEG A; 2CBB A; 4CAC A; 3M2N A; 2FOU A; 3C7P A; 1CA3 A; 3MNI A; 3N0N A; 1CIL A; 1HCA A; 2EU3 A; 3MNK A; 1BNU A; 3DV7 A; 2FMZ A; 1YDA A; 1CNC A; 3MNU A; 2POW A; 3DD0 A; 3F4X A; 3DC3 A; 1G48 A; 2HOC A; 1RZE A; 1BCD A; 1CAI A; 1CNG A; 1FR4 A; 1BN3 A; 2EZ7 A; 1CVA A; 3D8W A; 1LUG A; 3MHL A; 3CAJ A; 3LXE A; 1RJ5 A; 1XPZ A; 1ZSB A; 3M5T A; 4CA2 A; 3DVC A; 1YO1 A; 1I91 A; 1BV3 A; 2NNO A; 3F7B A; 3FFP X; 1H9Q A; 1TEU X; 2NWZ A; 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