Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | +31 | 23-255 | 233 | 1-22, 256-258 | 22 | 3 | knot |
Chain Sequence |
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLINFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
+ 31 | 24-254 | 231 | 1-23, 255-258 | 23 | 4 | knot |
Fingerprint | Knot forming loop | Loop type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
|
K +31 | His4 ... Val135 <-> Bridging ionHg262 <-> Gln137 ... Chain closureLys261 <-> His4 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His4 ... Val135 <-> Bridging ionHg262 <-> Cys206 ... Chain closureLys261 <-> His4 |
probabilistic | |||
|
K +31 | His4 ... Val135 <-> Bridging ionHg262 <-> Glu205 ... Chain closureLys261 <-> His4 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis4 <-> Lys261 ... Cys206 <-> Bridging ionHg262 <-> Gln137 ... His4 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureHis4 <-> Lys261 ... Glu205 <-> Bridging ionHg262 <-> Gln137 ... His4 |
probabilistic |
Chain Sequence |
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLINFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
|
Knotoid cutoff: 0.5
Knotoid matrix content: 1
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | 3.1 | 25-255 | 231 | 1-24, 256-257 | 24 | 2 | knot | |||||
view details | 2.1 | 24-251 | 228 | 1-23 | 257-257 | 252-256 | 23 | 1 | slipknot |
sequence length |
257
|
structure length |
257
|
publication title |
X-Ray Crystallographic Studies of Engineered Hydrogen Bond Networks in a Protein-Zinc Binding Site
pubmed rcsb |
molecule tags |
Lyase (oxo-acid)
|
molecule keywords |
CARBONIC ANHYDRASE II
|
source organism |
Homo sapiens
|
total genus |
Genus: 78
|
ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonate dehydratase. |
pdb deposition date | 1995-04-03 |
KnotProt deposition date | 2018-10-20 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00194 | Carb_anhydrase | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II | ||
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II |
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