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---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Chain Sequence |
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|
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
+ 31 | 26-254 | 229 | 1-25, 255-264 | 25 | 10 | knot |
Fingerprint | Knot forming loop | Loop type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
|
K +31 | Chain closureGlu4 <-> His267 ... His96 <-> Bridging ionZn268 <-> His94 ... Glu4 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureGlu4 <-> His267 ... His119 <-> Bridging ionZn268 <-> His96 ... Glu4 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Chain closureGlu4 <-> His267 ... His119 <-> Bridging ionZn268 <-> His94 ... Glu4 |
probabilistic |
Chain Sequence |
EWGYASHNGPDHWHELFPNAKGENQSPIELHTKDIRHDPSLQPWSVSYDGGSAKTILNNGKTCRVVFDDTYDRSMLRGGPLPGPYRLRQFHLHWGSSDDHGSEHTVDGVKYAAELHLVHWNPKYNTFKEALKQRDGIAVIGIFLKIGHENGEFQIFLDALDKIKTKGKEAPFTKFDPSSLFPASRDYWTYQGSLTTPPCEECIVWLLLKEPMTVSSDQMAKLRSLLSSAENEPPVPLVSNWRPPQPINNRVVRASFKHHHHHH
|
Knotoid cutoff: 0.5
Knotoid matrix content: 1
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | 3.1 | 26-254 | 229 | 1-25, 255-263 | 25 | 9 | knot | |||||
view details | 2.1 | 29-257 | 229 | 258-263 | 1-25 | 26-28 | 25 | 5 | slipknot |
sequence length |
263
|
structure length |
263
|
publication title |
Human Carbonic Anhydrase III: Structural and Kinetic Study of Catalysis and Proton Transfer
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Lyase
|
molecule keywords |
Carbonic anhydrase III
|
source organism |
Homo sapiens
|
total genus |
Genus: 73
|
ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonate dehydratase. |
pdb deposition date | 2005-03-31 |
KnotProt deposition date | 2018-10-20 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00194 | Carb_anhydrase | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II | ||
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II |
#chains in the KnotProt database with same CATH superfamily 3MNI A; 4CA2 A; 3DVD A; 3DC9 A; 3KWA A; 1Y7W A; 3NI5 A; 3C7P A; 1I9O A; 2HFW A; 1DMY A; 1F2W A; 1CNC A; 1TH9 A; 1YDA A; 3D0N A; 2FOS A; 1FQR A; 1CNI A; 3MHC A; 1FR7 A; 2HFX A; 3M96 A; 1CIN A; 3N3J A; 3CAJ A; 4CAC A; 2POU A; 1CRA A; 3M2Y A; 2VVA X; 1FQL A; 1I9L A; 3ML5 A; 3F7B A; 2OSM A; 1YDB A; 2WEO A; 1BNN A; 3DC3 A; 2FOQ A; 1CAN A; 3JXG A; 1ZE8 A; 1CVF A; 3MMF A; 2FNK A; 2O4Z A; 1OKN A; 1FLJ A; 3JXH C; 2HFY A; 1CA2 A; 3BL1 A; 2WEG A; 1CAY A; 1RJ5 A; 3MNK A; 2Q38 A; 2X7U A; 3M5S A; 1CNJ A; 2HNC A; 3OIM A; 3D92 A; 2NXT A; 3M1W A; 3K7K A; 3M5T A; 2POV A; 2NNO A; 3DVC A; 3F7U A; 1HCB A; 1CCT A; 2AW1 A; 2HD6 A; 1CVC A; 3KKX A; 3IGP A; 1I90 A; 3ZNC A; 1G0E A; 1CNG A; 3M98 A; 2AX2 A; 2FNN A; 1CAH A; 1BZM A; 1FSQ A; 1RJ6 A; 1TE3 X; 1KWQ A; 2FOU A; 2CBB A; 3N2P A; 1MUA A; 1BV3 A; 3ML2 A; 7CA2 A; 2WEH A; 3D8W A; 1LG5 A; 2FW4 A; 1CVE A; 1EOU A; 3MHO A; 3DA2 A; 1URT A; 1BN3 A; 3DCC A; 3OKU A; 1CAL A; 3MNH A; 3DVB A; 1H9Q A; 3HLJ A; 1T9N A; 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