Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | +31 | 28-257 | 230 | 1-27, 258-262 | 27 | 5 | knot |
Chain Sequence |
GHHGWGYGQDDGPSHWHKLYPIAQGDRQSPINIISSQAVYSPSLQPLELSYEACMSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPLEGPYRLKQFHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVVGVFLETGDEHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSCFNPKSLLPASRHYWTYPGSLTTPPLSESVTWIVLREPISISERQMGKFRSLLFTSEDDERIHMVNNFRPPQPLKGRVVKASFRA
|
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
+ 31 | 27-257 | 231 | 1-26, 258-262 | 26 | 5 | knot |
Fingerprint | Knot forming loop | Loop type | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
|
K +31 | Gly1 ... His94 <-> Bridging ionZn263 <-> His96 ... Chain closureAla262 <-> Gly1 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Gly1 ... Cys54 <-> Cys178 ... Chain closureAla262 <-> Gly1 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Gly1 ... His96 <-> Bridging ionZn263 <-> His119 ... Chain closureAla262 <-> Gly1 |
probabilistic | |||
|
K +31 | Gly1 ... His94 <-> Bridging ionZn263 <-> His119 ... Chain closureAla262 <-> Gly1 |
probabilistic |
Chain Sequence |
GHHGWGYGQDDGPSHWHKLYPIAQGDRQSPINIISSQAVYSPSLQPLELSYEACMSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPLEGPYRLKQFHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVVGVFLETGDEHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSCFNPKSLLPASRHYWTYPGSLTTPPLSESVTWIVLREPISISERQMGKFRSLLFTSEDDERIHMVNNFRPPQPLKGRVVKASFRA
|
Knotoid cutoff: 0.5
Knotoid matrix content: 1
Knot core range | Knot core length | Knot tails range | Slipknot tails range | Slipknot loops range | N-end length | C-end length | Type | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | 3.1 | 29-260 | 232 | 1-28, 261-262 | 28 | 2 | knot | |||||
view details | 2.1 | 27-255 | 229 | 1-26 | 261-262 | 256-260 | 26 | 2 | slipknot |
sequence length |
262
|
structure length |
262
|
publication title |
Crystal structure of the C183S/C217S mutant of human CA VII in complex with acetazolamide
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Lyase
|
molecule keywords |
Carbonic anhydrase 7
|
source organism |
Homo sapiens
|
total genus |
Genus: 75
|
ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonate dehydratase. |
pdb deposition date | 2010-04-16 |
KnotProt deposition date | 2018-10-20 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00194 | Carb_anhydrase | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II | ||
Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Carbonic Anhydrase II |
#chains in the KnotProt database with same CATH superfamily 2NXS A; 1LG6 A; 3LXE A; 1CA2 A; 3DA2 A; 3IBN A; 1UGF A; 1FQM A; 3KOK A; 2WEH A; 9CA2 A; 3M67 A; 1IF4 A; 1TBT X; 1CNY A; 3DVB A; 3DBU A; 1KWQ A; 1BNM A; 1V9I C; 3HLJ A; 2ZNC A; 1KEQ A; 1FSQ A; 3BET A; 3D92 A; 2POU A; 2NXT A; 1FQL A; 2HNC A; 1G4O A; 1I91 A; 2CA2 A; 1BN3 A; 2WEG A; 1ZSA A; 2AX2 A; 1YO2 A; 1TG9 A; 1BNQ A; 1G46 A; 2IT4 A; 1YO0 A; 1ZNC A; 1KWR A; 1UGA A; 1I90 A; 3F7U A; 3M5E A; 1A42 A; 3DCC A; 3MDZ A; 3FW3 A; 2NWY A; 2Q1B A; 3MHI A; 1YDB A; 1HUH A; 1G48 A; 3HKN A; 2O4Z A; 1BN1 A; 3BL1 A; 1I9Q A; 1AM6 A; 1CAL A; 2NWO A; 3MNA A; 3IBU A; 1ZE8 A; 1I9O A; 1HEC A; 1OKN A; 3HFP A; 1G0E A; 1HEA A; 3DC9 A; 2NNO A; 3M2Z A; 5CAC A; 1HEB A; 1URT A; 1BNU A; 5CA2 A; 2FMG A; 1FQR A; 1TTM A; 1TG3 A; 2Q1Q A; 2X7S A; 3CZV A; 1XEG A; 3OIK A; 1G4J A; 3F4X A; 2CAB A; 2CBA A; 2EU3 A; 1CZM A; 2NNS A; 3NJ9 A; 3MNU A; 1UGE A; 2CBB A; 1HED A; 3B1B A; 3MYQ A; 2FOU A; 1CNW A; 1I8Z A; 1OQ5 A; 1CIL A; 1I9P A; 1CAM A; 2CBD A; 2CBC A; 1F2W A; 1I9L A; 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